废水消毒处理方法包括氯化法、臭氧法、紫外线消毒法，对于含有放射性同位素的污水，应该按同位素处理要求处理，为了消灭废水和污泥中的病原体和微生物进行的处理过程，可以分为废水消毒和污泥消毒，医院废水在处理过程中，污泥中细菌、病毒、寄生虫卵经熟石灰消毒和高温堆肥后方可用作肥料，医院废水的水质十分复杂，一般随着用水量的增大，相应的污染物浓度越来越高，医疗废水是广大人民群众重点关注的问题，医疗废水的排放对水资源造成了巨大危害，已经成为危害人民群众健康的源头，废水排放达标的医院少之又少，当下，人民环保意识的淡薄和法律的不完善，是造成医院废水排放不达标的重要原因。因此，国家各级环保部门应该高度重视，颁布医疗废水处理新法规，彻底解决一直困扰人民群众的医院废水排放问题。医疗废水处理应该一直秉承全过程控制原则，减量化原则，就地处理原则，分类指导原则，达标与风险控制相结合原则，生态安全原则。
医疗废水处理流程：预处理—一级处理—二级处理—深度处理—消毒—出水
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