小鼠Kupffer细胞是否存在肝窦内皮细胞污染？

撰文 | 我的闺蜜老红帽

2022年7月12日，澳大利亚昆士兰大学的David A. Hume等在Immunity上发表了质疑文章Contamination of isolated mouse Kupffer cells with liver sinusoidal endothelial cells，指出这群肝窦内皮细胞相关的巨噬细胞，其转录组与巨噬细胞全RNA测序数据的大维度宏测序分析并不匹配【4】，而此库中还涵盖了单核细胞向Kufffer细胞分化的数据。

David A. Hume等人还指出KC2最为富集的基因Gpr182同样可以编码内皮细胞特异性非典型趋化因子受体。为了进一步研究GPR182在小鼠肝脏中的表达情况，David A. Hume等人在含有Gpr182-mCherry的 告小鼠中标记Kuffer细胞特异性标志F4/80，并进行荧光三维成像。他们确定，Gpr182和F4/80明显不存在共定位现象。基于上述这些事实都说明，David A. Hume等人在Immunity中发表题为的争鸣文章，称Contamination of isolated mouse Kupffer cells with liver sinusoidal endothelial cells所谓的KC2，其实是肝窦内皮细胞污染。

为了回应相关质疑，Matteo Iannacone等人在同期发表题为Response to contamination of isolated mouse Kupffer cells with liver sinusoidal endothelial cells的文章。

Matteo Iannacone等人回应称，不能选择性根据某个或某些基因的表达来判断细胞类型。虽然这一方法在某些小鼠细胞上是可行的，比如CD3之于T细胞，但并不是所有细胞类型都行得通。比如巨噬细胞表达F4/80，但嗜酸性粒细胞同样也表达，虽然水平相对较低。同样的，编码CD206的基因Mrc1，不仅在肝窦内皮细胞上表达，同样表达于巨噬细胞。这也是新的细胞亚群能发现定义之所在。

回到单细胞测序数据，多篇 道指出小鼠和人类肝脏巨噬细胞的特性均与Matteo Iannacone等人 道的细胞类似【5-7】。Matteo Iannacone等人还回应称，与David A. Hume等人产生分歧的主要原因之一是单细胞测序技术的局限性。虽然其高分辨度可以有效解决一些生物学问题，但是基因片段含量相对较少则带来了无法全面展示细胞特性的弱点。Matteo Iannacone等人的工作基于单细胞测序结果之余，还整合了群细胞测序、蛋白质组学、细胞发育制图技术（fate-mapping models）和质谱等等研究手段。Matteo Iannacone等人还通过RiboTag和成像流式细胞分析技术确定，虽然的确存在一部分Kuffer细胞-内皮细胞二聚，但也的确发现一类CD45+CLEC4F+ESAM+CD206+单细胞亚型。

原文链接：

https://doi.org/10.1016/j.immuni.2022.06.010

https://doi.org/10.1016/j.immuni.2022.06.012

制版人：十一

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